二、
緣原告採連結稅制，併同其子公司合併辦理100年度
營利事業所得稅結算申報，列報：（一）子公司玉山商業銀行股份有限公司（下稱玉山銀行）、玉山綜合證券股份有限公司（下稱玉山證券公司）、玉山創業投資股份有限公司（下稱玉山創投公司）及玉山保險經紀人股份有限公司（下稱玉山保經公司）薪資支出新臺幣（下同）4,107,652,065元、327,820,104元、7,689,191元及74,954,316元，經
被告依申報數
核定，
嗣原告申請更正為4,355,416,602元、341,180,205元、8,192,014元及76,515,973元，併復查審理。（二）子公司玉山證券公司「第58欄」（投資收益減除相關營業費用及利息支出後淨額；下稱『第58欄』）0元及停徵之證券、期貨交易所得負133,498,870元，經被告分別核定為15,900,664元及負134,914,710元。（三）子公司玉山創投公司營業收入總額494,148,817元、「第58欄」0元及停徵之證券、期貨交易所得94,897,270元，經被告分別核定為534,407,119元、30,235,138元及81,264,121元。（四）合併結算申報所得額合計數3,300,298,807元、前10年核定合併營業虧損本年度
扣除額293,959,768元及合併結算申報課稅所得額3,006,339,039元，經被告核定為3,389,381,793元、111,871,533元及3,277,510,210元，嗣更正玉山創投公司之兌換盈餘1,299,806元為0元，重行核定合併結算申報所得額合計數3,388,081,987元、前10年核定合併營業虧損本年度扣除額111,871,533元及合併結算申報課稅所得額3,276,210,454元。原告不服，申請復查，嗣撤回玉山創投公司營業收入總額、「第58欄」及停徵之證券、期貨交易所得之復查，另申請更正前10年核定合併營業虧損本年度扣除額為421,694,411元，併復查審理。案經復查決定，獲追認子公司玉山銀行、玉山證券公司、玉山創投公司及玉山保經公司薪資支出247,764,537元、13,360,101元、502,823元及1,561,657元，追減子公司玉山證券公司「第58欄」938元及停徵之證券、期貨交易所得426,364元，併同追減合併結算申報課稅所得額262,761,816元，其餘復查駁回。原告對前10年核定合併營業虧損本年度扣除額部分，仍表不服，提起
訴願。業經決定駁回，遂提起本件行政訴訟。